La réforme de la facturation électronique a changé la donne : depuis septembre 2026, toute entreprise doit pouvoir recevoir des factures électroniques, et l’émission devient obligatoire par paliers. Un logiciel de facturation n’est plus un confort, c’est une obligation, et autant qu’il fasse aussi la comptabilité. Nous avons comparé sept outils pensés pour les indépendants et les TPE, avec un critère de départ non négociable : être une plateforme agréée ou s’appuyer sur l’une d’elles.
Le meilleur pour un indépendant seul : Indy, gratuit en facturation et très complet dès 9 € HT. Le meilleur pour une micro-entreprise : Abby, avec les déclarations URSSAF dès 9 € HT. Le plus solide pour une société qui travaille avec un cabinet : Pennylane. Le plus simple pour facturer sans se poser de questions : Tiime, gratuit et agréé. Pour une TPE avec des commerciaux : Axonaut, qui ajoute CRM et gestion.
Tableau comparatif
Prix HT par mois, relevés en septembre 2026. « Agréé » signifie que l’éditeur est une plateforme agréée par l’administration fiscale pour la facturation électronique, ou s’appuie directement sur l’une d’elles.
| Logiciel | Gratuit | Premier palier payant | Facturation électronique | Déclarations URSSAF | Bilan / liasse | Pour qui | |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Indy | Oui, facturation illimitée | Plus 9 € | Agréé | Oui (Premium) | Oui, via expert-comptable partenaire | Micro, EI, SASU/EURL, SCI | Voir |
| Abby | Oui | Start 9 € | Oui | Oui, dès Start | Non | Micro-entrepreneurs | Voir |
| Pennylane | Oui (micro) | Starter 7 € | Agréé | Non trouvé | Oui (Premium ou cabinet) | TPE, PME, sociétés avec cabinet | Voir |
| Tiime | Oui, facturation illimitée | Smart 17,99 € | Agréé | Non | Non | Freelances, TPE | Voir |
| Freebe | Essai 30 jours | 15 € (micro) | Oui | Oui | Non | Freelances, artistes-auteurs | Voir |
| Axonaut | Essai 15 jours | Dès 35 à 70 € selon engagement | Agréé | Non | Partiel | TPE avec équipe commerciale | Voir |
| Sinao | Oui (5 factures/mois) | Start 12 € | Conforme, non agréé | Non | Export FEC | Artisans, associations | Voir |
Notre sélection
Indy
Comptabilité et facturation des indépendants, du gratuit au bilan
Essentiel 0 €, Plus 9 € HT, Premium 15 à 49 € HT selon statut
- Facturation illimitée et plateforme agréée dès l'offre gratuite
- Déclarations URSSAF et TVA télétransmises en Premium
- Bilan et liasse validés par un expert-comptable partenaire en option
- Compte pro gratuit intégré
- Un seul utilisateur
- Écosystème fermé : l'intérêt maximal suppose d'utiliser aussi le compte Indy
Indy couvre le parcours complet d’un indépendant : facturer gratuitement au début, passer à 9 € pour automatiser la comptabilité, puis ajouter les déclarations et le bilan quand l’activité le justifie. Peu d’outils offrent une progression aussi lisible, et le compte pro gratuit qui va avec fait baisser le coût global de la gestion à quasiment zéro pour un micro-entrepreneur.
Abby
Le spécialiste de la micro-entreprise
Basique 0 €, Start 9 € HT, Pro 15 € HT, Business 33 € HT (promotions fréquentes)
- Déclarations URSSAF automatisées dès 9 € HT
- Estimation des cotisations en temps réel
- Facturation électronique sur tous les plans
- Interface pensée pour les non-comptables
- Pas de bilan ni de liasse : inadapté aux sociétés
- Moins connu qu'Indy ou Pennylane
Si vous êtes en micro-entreprise et que votre seule obligation comptable est la déclaration URSSAF, Abby est probablement l’outil le plus agréable du marché : il fait exactement cela, sans surcharge. Ses promotions récurrentes (jusqu’à 40 % sur l’annuel) le rendent souvent moins cher que l’affichage.
Pennylane
La plateforme des entreprises qui travaillent avec un cabinet
Gratuit (micro), puis Starter 7 € HT, Basique 14 € HT, Essentiel 24 € HT
- Plateforme agréée, pré-comptabilité automatisée de haut niveau
- Utilisée par des milliers de cabinets : collaboration native avec votre expert-comptable
- Compte pro intégré
- Offre gratuite réelle pour les micro-entreprises
- Pas de rapprochement bancaire sur l'offre gratuite
- Clôture, liasse et TVA réservées au palier Premium ou au cabinet
- Grille tarifaire qui varie selon les sources : à vérifier au moment de souscrire
Pennylane est le choix naturel d’une SASU, d’une SARL ou d’une SAS dont la comptabilité est tenue ou révisée par un cabinet : vous saisissez, le cabinet valide, tout est au même endroit. Pour un indépendant seul sans cabinet, Indy est plus simple et moins cher.
Tiime
Facturer gratuitement, sans limite
Free 0 €, Smart 17,99 € HT, Business 24,99 € HT
- Devis et factures illimités gratuitement
- Plateforme agréée, Factur-X
- Compte pro inclus dans les offres payantes
- Pas de déclarations URSSAF
- Pas de bilan
- Mono-devise, API réservée à Business
Tiime est l’outil de facturation pur : si vous voulez émettre des factures conformes gratuitement et faire le reste ailleurs, il est irréprochable. Pour la comptabilité, il faudra un autre outil ou un cabinet.
Les autres outils du panel
Freebe (15 € par mois en micro) a longtemps été la référence des freelances et gère bien les déclarations URSSAF et le suivi du temps ; il n’a pas d’offre gratuite et son évolution est jugée lente, mais il reste solide, notamment pour les artistes-auteurs. Axonaut n’est pas un logiciel de compta mais un petit ERP (CRM, devis, factures, compta, RH) : il devient pertinent dès qu’il y a une équipe commerciale, à un prix qui dépend fortement de la durée d’engagement. Sinao est conforme à la facturation électronique mais n’est pas plateforme agréée, ce qui le désavantage désormais ; nous ne l’avons pas retenu. Henrri facture gratuitement mais passe par la plateforme agréée de Pennylane : autant choisir Pennylane directement.
Facturation électronique 2026 : ce qui change vraiment
Le calendrier de la réforme impose à toutes les entreprises assujetties à la TVA de pouvoir recevoir des factures électroniques via une plateforme agréée depuis le 1er septembre 2026. L’obligation d’émettre suit pour les grandes entreprises et les ETI à la même date, et pour les PME, TPE et micro-entreprises au 1er septembre 2027. Concrètement, si vous facturez des professionnels, votre outil doit être (ou passer par) une plateforme agréée. Indy, Pennylane, Tiime et Axonaut le sont. Abby et Freebe s’appuient sur des plateformes partenaires. C’est un critère à vérifier avant tout autre, parce que changer d’outil de facturation en cours d’exercice est une corvée.
Comment choisir selon votre statut
Micro-entrepreneur : vos obligations sont la déclaration de chiffre d’affaires à l’URSSAF, le livre des recettes et des factures conformes. Abby ou Indy (Premium pour les déclarations) suffisent, et leurs offres gratuites couvrent le démarrage.
Entreprise individuelle au réel (BNC ou BIC) : il faut une vraie comptabilité et une déclaration de résultat. Indy est conçu pour cela et permet de tout faire soi-même ; Pennylane si vous êtes accompagné par un cabinet.
SASU, EURL, SARL, SAS : bilan, liasse fiscale, approbation des comptes. Indy propose la validation par un expert-comptable partenaire (63 à 108 € HT par mois), Pennylane est la norme des cabinets. Dans les deux cas, comparez le coût total logiciel plus cabinet plutôt que le seul abonnement.
Indy est le meilleur outil pour un indépendant qui veut gérer seul, du gratuit jusqu’au bilan. Abby est le plus agréable pour une micro-entreprise. Pennylane s’impose dès qu’un cabinet entre dans l’équation. Et si vous ne voulez que facturer, Tiime le fait gratuitement et proprement.
Essayer Indy gratuitement Découvrir Pennylane
Questions fréquentes
Un auto-entrepreneur doit-il utiliser un logiciel de facturation en 2026 ?
Il doit pouvoir recevoir des factures électroniques depuis septembre 2026 et devra en émettre à partir de septembre 2027 s’il facture des professionnels assujettis à la TVA. Un logiciel agréé ou relié à une plateforme agréée est donc fortement recommandé, d’autant que plusieurs sont gratuits.
Quel logiciel de comptabilité gratuit pour indépendant ?
Indy (facturation illimitée et plateforme agréée), Tiime (facturation illimitée), Pennylane (offre micro) et Abby (offre Basique) proposent des offres gratuites réelles. Les déclarations et la comptabilité complète sont payantes chez tous.
Faut-il quand même un expert-comptable ?
Ce n’est jamais obligatoire pour une micro-entreprise ou une entreprise individuelle. Pour une société, ce n’est pas non plus une obligation légale, mais la production du bilan et de la liasse sans accompagnement est risquée ; Indy et Pennylane proposent des solutions intermédiaires moins chères qu’un cabinet classique.
Méthodologie : tarifs et fonctionnalités relevés sur les pages officielles ou, à défaut, sur des sources datées de 2026, le 29 septembre 2026. Lire notre méthodologie.